Què cal saber
- Un fitxer FNA és un fitxer d'alineació de seqüències d'ADN i proteïnes en format FASTA.
- Obre'n una amb Geneious.
- Converteix a formats FASTA i similars amb el mateix programa.
Aquest article explica què és un fitxer FNA, com obrir-ne un i com desar-ne un en un format diferent, com ara FASTA, GB, VCF, imatges, etc.
Què és un fitxer FNA?
Un fitxer amb l'extensió de fitxer FNA és un fitxer d'alineació de seqüències d'ADN i proteïnes amb format FASTA que emmagatzema informació d'ADN que pot utilitzar el programari de biologia molecular.
Els fitxers FNA, en concret, es poden utilitzar per contenir només informació d'àcids nucleics, mentre que altres formats FASTA contenen altra informació relacionada amb l'ADN, com els que tenen FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET o AA.
Aquests formats FASTA basats en text van sorgir originalment d'un paquet de programari amb el mateix nom, però ara s'utilitzen com a estàndard en aplicacions d'alineació de seqüències d'ADN i proteïnes.
FNA també fa referència a alguns termes tecnològics que no tenen res a veure amb aquest format de fitxer, com ara l'acceptació final de la xarxa, la instal·lació d'augment de noms/atributs de fitxers, l'arquitectura de xarxa de Fujitsu i l'anunci ràpid de veïnes.
Com obrir un fitxer FNA
Obre'n un a Windows, macOS i Linux amb Geneious (és gratuït durant 14 dies). Per fer-ho, aneu al menú Fitxer > Importa i trieu importar el fitxer mitjançant el Des del fitxer element del menú.
També podríeu obrir-ne un amb BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Proveu Notepad++ o un altre editor de text si aquestes idees no funcionen. El fitxer pot estar basat en text i fàcil de llegir, o potser trobareu que no té res a veure amb el format FASTA, en aquest cas, obrir el fitxer com a document de text pot revelar text que identifiqui què s'ha utilitzat per crear el fitxer. o en quin format té el fitxer.
Com convertir un fitxer FNA
No podem verificar-ho perquè no ho hem provat, però hauríeu de poder utilitzar Geneious per convertir el fitxer a molts altres formats, com ara FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV i VCF. Això es pot fer mitjançant el menú Fitxer > Exporta del programa.
Aquest mateix programa també hauria de poder desar el fitxer a PNG, JPG, EPS o PDF, mitjançant Fitxer > Desa com a fitxer d'imatge.
Tot i que normalment no podeu canviar el nom de l'extensió d'un fitxer a una altra cosa i esperar que funcioni de la mateixa manera, podeu canviar el nom d'un fitxer. FNA a un fitxer. FA si el vostre programari de seqüenciació d'ADN només reconeixerà el format FA.
En lloc de canviar el nom de les extensions de fitxer, voldreu utilitzar un convertidor de fitxers gratuït per convertir altres tipus de fitxers. En el cas dels fitxers FNA i FA, passa per casualitat que alguns programes només obriran fitxers que tinguin l'extensió de fitxer FA, en aquest cas canviar-los el nom hauria de funcionar bé.
Encara no el pots obrir?
Si després d'utilitzar els programes de d alt, encara no podeu fer que el vostre fitxer s'obri, és possible que trobeu que l'extensió del fitxer en realitat no llegeix. FNA, sinó una cosa que sembla semblant.
Per exemple, els fitxers FNG (Font Navigator Group) semblen molt semblants a ". FNA", però si us fixeu bé, només les dues primeres lletres són iguals. Com que les extensions de fitxer són diferents, és una indicació que tenen un format de fitxer diferent i que probablement no funcionen amb els mateixos programes.
El mateix es podria dir de moltes altres extensions de fitxers com FAX, FAS (AutoLISP de càrrega ràpida compilada), FAT, FNTA (Font Aleph One), FNC (Funcions de vista) i FND (Cerca desada de Windows).
La idea aquí és només assegurar-se que l'extensió del fitxer digui. FNA. Si ho fa, torneu a provar d'utilitzar els programes de d alt per obrir-lo o convertir-lo. Si teniu un tipus de fitxer diferent, investigueu la seva extensió per esbrinar quines aplicacions calen per obrir-lo o convertir-lo.
FAQ
Com s'obre un fitxer FNA a Python?
Primer, convertiu el fitxer FNA al format FASTA mitjançant una aplicació de tercers com ara Geneious. A continuació, podeu descarregar Biopython, un conjunt d'eines de lliure disposició per a la computació biològica per treballar en bioinformàtica. Finalment, consulteu el tutorial i el llibre de cuina de Biopython per obtenir instruccions sobre com treballar amb fitxers FASTA.
Com puc trobar els meus números de creador de FNA en un fitxer en brut d'Ancestry?
Podeu baixar la majoria de dades d'ADN d'Ancestry.com en format.txt. Tanmateix, només els clients l'ADN dels quals s'ha analitzat amb seqüenciació de nova generació (NGS) tenen l'opció de descarregar un fitxer VCF. Per baixar un fitxer VCF, has de ser el propietari de l'ADN, fer-te una prova d'ADN amb la tecnologia NGS i tenir almenys 350 MB d'espai disponible al teu dispositiu.
